Die in Vilnius geborene Giedrė Šlekytė studierte Dirigieren an der Kunstuniversität Graz, der Hochschule für Musik und Theater Leipzig sowie an der Zürcher Hochschule der Künste. Als international gefragte Gastdirigentin arbeitete sie bereits mit international renommierten Klangkörpern wie den Wiener Symphonikern, der Sächsischen Staatskapelle Dresden, dem Orchestre Philharmonique de Radio France und dem Bruckner Orchester Linz zusammen, deren 1. Gastdirigentin sie seit der Spielzeit 2021/22 ist. Nach ihrem Engagement als 1. Kapellmeisterin am Stadttheater Klagenfurt von 2016-2018 dirigierte sie an den Opernhäusern in Leipzig, Zürich, Antwerpen, Frankfurt und bei den Salzburger Festspielen. Seit der Spielzeit 2021/22 ist sie Assistentin des Generalmusikdirektors der Bayerischen Staatsoper, Vladimir Jurowski. Im Rahmen dieser Tätigkeit dirigierte sie u. a. Produktionen wie »La traviata« und die Neuproduktion »L´infedeltà delusa«. Darüber hinaus dirigierte sie »Carmen« an der Oper Frankfurt und leitete die Neuproduktion von »Katja Kabanowa« an der Komischen Oper Berlin. Im Herbst 2019 erschien bei der Deutschen Grammophon die vielbeachtete Porträt-CD »Raminta Šerkšnytė«, auf der sie das Oratorium »Songs of Sunset and Dawn« mit dem Lithuanian National Symphony Orchestra dirigiert. 
Giedrė Šlekytė ist Preisträgerin des Internationalen Malko-Dirigentenwettbewerbs 2015 und wurde für den Young Conductors Award der Salzburger Festspiele 2015 sowie als »Newcomer des Jahres« bei den International Opera Awards 2018 nominiert.